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硝化作用是由一种硝化细菌完成的。

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微生物对含氮有机物的分解，首先是发生氨化作用。这可以在有氧，也可以在无氧环境下。但都有无机氨的产生。

微生物在有氧条件下分解有机物速度较快，其中碳元素被转化为CO2，氢元素被转化为水。

微生物对有机物分解，可以是在有氧条件下，也可以在缺乏氧的环境下。

微生物对大分子有机物的水解，是在细胞内完成的。