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激素水平引起玻璃化苗，包括生长素和细胞分裂素，一方面指细胞分裂素的浓度，另一方面是以上两种激素的比例平衡。高浓度的细胞分裂素，尤其是6-BA，有利于促进芽的分化，也会使玻璃化的发生比例提高。

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玻璃化试管苗，其茎、叶表面无蜡质，细胞持水力差，植株蒸腾作用强，无法进行正常移栽。

培养基成份，如无机盐浓度，细胞分裂素水平对褐变并没有影响，主要是外植体种类与品种的区别。

一般来说，已经成年的植株采收的外植体，由于含醌类物质较少，因此褐变较为轻。

褐变与植物种类没有关系，在组织培养中普遍存在。